O jogo acontece em um universo paralelo para o romance visual destino/noite
A partir da década de 2030, a mana do mundo se foi completamente.
O universo de compartilha extra dos eventos da War fighting for Fate Extra até um "grande incidente importante" na década de 1970
Isso fez com que a mana do mundo comece a secar a se separe em seu próprio universo separado.
O mundo se passa em uma escola chamada Tsukumihara Academy, um lugar fictício existente com um ambiente artificial chamado Lua Célula.
Lá, a célula da lua orquestra uma replicação da guerra do Santo Graal usando um sistema chamado Phantasm Série ou Se.ra.ph,
que lida com a convocação de servos.
Os dados do servo são retirados do autômato,
Um sistema de computador espiritual construído na superfície lunar por uma civilização pré-humana e descoberta pelos seres humanos no ano de 2032.
O autômato monitorou e registrou todas as ocorrências na Terra (incluindo as atividades dos heróis humanos) desde os tempos imemoriais.
Nesse sentido, é semelhante ao trono dos heróis.
Ao contrário da contraparte noturna do destino/estadia, todos os envolvidos são personalidades humanas que funcionam como NPCs,
Ou hackers, resultando no que Rin ela mesma chamou de "sistema justo", pois não envolve inocentes.
Além disso, os servos devem transmitir a vontade da célula da lua acima de suas próprias necessidades.
Cada um dos 128 participantes da guerra deve duelar com os outros mestres em um lugar chamado arena,
onde o fracasso resulta em exclusão do mundo digital e morte no outro.
Quando apenas um permanecer, o "Santo Graal" concederá o desejo do vencedor.
Acordando em um mundo virtual estranho sem lembrança do passado,
O personagem principal se vê forçado a lutar pela sobrevivência em uma guerra que não entendem por um prêmio além do valor;
a oportunidade de ter o desejo de alguém concedido.
Com apenas um enigmático "servo" ao seu lado,
Hakuno Kishinami terá que enfrentar amigos e inimigos em batalhas até a morte para não apenas obter posse de um objeto misterioso conhecido como "Santo Graal".
Mas também para encontrar a resposta para a pergunta mais importante de todas: "Quem sou eu?"
Vamos para a War fighting for Fate Extra ...